MAC0465  Biologia Computacional

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OBJETIVOS:  Apresentar uma introdução aos principais algoritmos que têm sido desenvolvidos para problemas da biologia computacional, servindo de partida para um estudo posterior mais aprofundado de tópicos abordados no curso.

RESPONSÁVEIS:  Alair Pereira do Lago e José Augusto Ramos Soares.

PROGRAMA:  Comparação de seqüências e suas variações. Busca de seqüências em base de dados. Árvores filogenéticas. Sequenciamento e Montagem. Rearranjo de Genomas. Predição de estruturas moleculares. Aplicações de chips de DNA.

PRÉ-REQUISITO:  MAC0121.

CARGA HORÁRIA SEMANAL E NÚMERO DE CRÉDITOS:  4 horas, 4 créditos-aula.

CRITÉRIO DE AVALIAÇÃO DA APRENDIZAGEM:  Média ponderada de provas e trabalhos.

BIBLIOGRAFIA BÁSICA: 

  • J. Meidanis and J.C. Setubal, Introduction to Computacional Molecular Biology, PWS Publishing Company, Boston, 1997.
  • D. Gusfield, Algorithms on Strings, Trees and Sequences, Cambridge University Press, 1997.
  • N.C. Jones and P.A. Pevzner, An Introduction to Bioinformatics Algorithms, MIT Press, Cambridge, 2004.
  • P.A. Pevzner, Computational Molecular Biology: An Algorithmic Approach, MIT Press, Cambridge, 2004.
  • M.S. Waterman, Introduction to Computational Biology, Maps, Sequences and Genomes, Chapman & Hall, 1995.

OBSERVAÇÃO:  Disciplina optativa eletiva no currículo do BCC.

 

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Oferecimentos recentes da disciplina: 2004/2, 2003/2.