MAC0465 Biologia Computacional
OBJETIVOS: Apresentar uma introdução aos principais algoritmos que têm sido desenvolvidos para problemas da biologia computacional, servindo de partida para um estudo posterior mais aprofundado de tópicos abordados no curso.
RESPONSÁVEIS: Alair Pereira do Lago e José Augusto Ramos Soares.
PROGRAMA: Comparação de seqüências e suas variações. Busca de seqüências em base de dados. Árvores filogenéticas. Sequenciamento e Montagem. Rearranjo de Genomas. Predição de estruturas moleculares. Aplicações de chips de DNA.
PRÉ-REQUISITO: MAC0122.
CARGA HORÁRIA SEMANAL E NÚMERO DE CRÉDITOS: 4 horas, 4 créditos-aula.
CRITÉRIO DE AVALIAÇÃO DA APRENDIZAGEM: Média ponderada de provas e trabalhos.
BIBLIOGRAFIA BÁSICA:
- J. Meidanis and J.C. Setubal, Introduction to Computacional Molecular Biology, PWS Publishing Company, Boston, 1997.
- D. Gusfield, Algorithms on Strings, Trees and Sequences, Cambridge University Press, 1997.
- N.C. Jones and P.A. Pevzner, An Introduction to Bioinformatics Algorithms, MIT Press, Cambridge, 2004.
- P.A. Pevzner, Computational Molecular Biology: An Algorithmic Approach, MIT Press, Cambridge, 2004.
- M.S. Waterman, Introduction to Computational Biology, Maps, Sequences and Genomes, Chapman & Hall, 1995.
OBSERVAÇÃO: Disciplina optativa eletiva no currículo do BCC.
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